临床上分为二类：

1、新生儿包涵体结膜炎，又称新生儿包涵体性脓漏眼。新生儿出生时，在患衣原体性宫颈炎的产道中受感染，潜伏期5～12天。眼睑红肿，睑结膜充血、肥厚、乳头肥大，主要见于下穹窿及下睑结膜。新生儿结膜的腺样层尚未发育，故2～3个月内无滤泡形成。分泌物为脓性，量多，故应与新生儿淋菌性结膜炎鉴别，可作涂片检查，如系新生儿包涵体炎，基本不见细菌，并有包涵体。大约2～3周后转入慢性期。晚期有显著的滤泡形成，3个月至1年内自行消退，不留瘢痕，亦无角膜血管翳。

2、成人包涵体性结膜炎，又名游泳结膜炎，因为许多患者都有在污染的游泳池游泳史，实际上此病是由沙眼衣原体D－K型泌尿系统感染后污染的手、毛巾或水等传染到眼；有称是一种接触感染。潜伏期5～12天。开始时结膜充血，很快眼睑红肿，耳前淋巴结肿大，穹窿部结膜有很多滤泡，下方最著。结膜因细胞浸润而肥厚。结膜囊有很多脓性分泌物，内含大量多形核白细胞。结膜刮片可见包涵体。急性期消退后，结膜仍肥厚、充血、有滤泡，持续3个月至1年，不出现血管翳，不留瘢痕，而自然消退。